Della nuova Scuola si faceva promotore e sostenitore lo Studio Teologico San Zeno che, com'è noto, è una confederazione di precedenti scuole di teologia del Seminario e dei Religiosi esistenti in diocesi, cui era stato dato il via nell'ottobre del 1965 per rispondere alle esigenze di rinnovamento della formazione e degli studi del clero promosso dal Concilio Vaticano II. Anche la sede comune sottolineava lo stretto legame tra le due istituzioni.

Al suo vertice era un Consiglio di Presidenza e una Direzione, mentre gli iscritti furono per il primo anno 161.
La nuova Scuola risultava organizzata sostanzialmente attorno alle materie fondamentali svolte pure allo Studio Teologico San Zeno, dal quale provenivano in gran parte anche i docenti. Il formarsi di un proprio piano di studi risentì evidentemente del benefico influsso del San Zeno, anche se non fu fatto proprio in modo definitivo il sistema dei temi fondamentali adottato in esso.
Un tentativo di introdurre la distinzione tra temi fondamentali: Cristo, Chiesa, Dio vivente, Morale cristiana, e corsi integrativi, comprendenti i restanti argomenti, fu fatto negli anni 1970-74. L'articolazione poi dei temi in due momenti principali, biblico e sistematico, svolti rispettivamente da un biblista e da un teologo sistematico, interessò solo il biennio 1972-74. In seguito si tornò e ci si attenne al sistema classico dell'organizzazione della materia in corsi. 

Intanto la partecipazione s'era andata riducendo, passando dai 161 iscritti del 1967 ai 26 del 1971-72 per passare ai 29 del 1972-73. Ciò segnalava anche nella Scuola San Pietro Martire un momento di fatica, del resto diffusa in ambienti più vasti della Chiesa e della società in quegli anni. 
La qualità dei partecipanti comunque non doveva essere scarsa, a giudicare almeno dalle tesine elaborate per il conseguimento del diploma in quel primo periodo.

In una seconda fase della vicenda, per l'anno 1973-74 si nota una qualche novità di rilievo. Nell'illustrazione delle sue finalità si specifica che una formazione teologica a livello scientifico è un aiuto per coloro che intendono maturare la propria fede: per questi appunto la Scuola è aperta. Non si parla più di una Presidenza, ma solo della Direzione, presieduta dal Vescovo, guidata da un Direttore e della quale sono chiamati a far parte rappresentanti del collegio docenti, del gruppo allievi ed ex allievi e il Direttore dello Studio Teologico San Zeno.
Anche il nome della Scuola risulta cambiato, con la sostituzione di Scuola per Laici e Religiosi, al posto di Religiose, come era inizialmente.

Un tale cambiamento risultò stabile fino al 1985 quando, in armonia con la nota pastorale della CEI La formazione teologica nella Chiesa particolare, il nome venne mutato in Scuola di Formazione Teologica San Pietro Martire e il 18 giugno dell'anno successivo fu riconosciuta come Istituto di Scienze Religiose San Pietro Martire, ad triennium et ad experimentum, riconoscimento in seguito rinnovato.

Questi i dati salienti, per così dire burocratici. Dietro di essi sta il delinearsi progressivo del programma cui si è accennato. 
Una sua stesura risalente al 1979/80 illustra l'iter formativo attraverso il quale l'allievo è condotto alla conoscenza dell'uomo, nella sua identità e aperture (antropologia filosofica), nei suoi valori e problematiche religiose, sia dal punto di vista della religione che della filosofia (psicologia e filosofia della religione). Il cammino di studio si approfondisce e concentra intorno alla Parola di Dio colta come storia della salvezza (esegesi di Antico e Nuovo Testamento) e come origine e fondamento della fede ecclesiale (il mistero del Dio vivente, di Cristo, della Chiesa, della Chiesa nei Sacramenti) che esige continuamente di essere celebrata (liturgia) e tradotta in vita (corsi di teologia morale). La serie di lezioni si conclude con uno sguardo alla Chiesa considerata nella sua storia lungo i secoli (storia della Chiesa) e considerata nel suo farsi serva della Parola (catechesi).
Tale il piano di studio della Scuola alla conclusione dell'episcopato Carraro.

La pubblicazione del libro per il venticinquesimo della fondazione, dal titolo Teologia: itinerario verso una fede adulta, Verona 1993, permette di illustrare altri aspetti della vicenda dell'Istituto. 
Di notevole importanza si è rivelata ad esempio l'iniziativa di cominciare ogni nuovo anno scolastico con una Tre giorni biblica in cui uno specialista illustra un libro della Bibbia. Le Tre giorni che si tengono dal 1976 hanno visto succedersi un buon numero di biblisti italiani a illustrare diversi libri della Sacra Scrittura. I numerosi partecipanti sono costituiti non solo dagli allievi ed ex-allievi della Scuola, ma anche da altre persone sensibili alla Parola di Dio. 

Tra gli aspetti interessanti si rileva poi quello del ricambio dei docenti che vi hanno insegnato nei diversi anni come anche quello dello spostamento di accento nello svolgimento dei programmi. 
Ancora maggior interesse presenta il diagramma delle iscrizioni e delle frequenze. I dati della Scuola e dell'Istituto che ne ha preso il posto parlano di più di 3300 iscritti fino ad oggi, con una media annuale di circa 125 iscritti nel periodo 1986-2001. Le persone interessate, con una progressiva prevalenza dei laici, le motivazioni che hanno spinto i partecipanti, il livello di formazione già acquisita, le attese e la rispondenza del programma a tali attese soggettive e oggettive possono costituire altrettanti argomenti di ricerca e di riflessione.
Quanto ai partecipanti, si può senz'altro notare che da una élite dell'Azione Cattolica, sollecitata dal Concilio, si è passati a cristiani adulti più generalmente impegnati nelle parrocchie e in ricerca di una maturazione di fede, mentre le religiose, che costituivano inizialmente circa un quarto degli allievi, sono andate calando, si può dire "fisiologicamente", avendo completato progressivamente la loro formazione.
Tra le attese, più varie e pluralistiche, vanno senz'altro tenute presenti quelle connesse con l'attività della scuola di religione o della catechesi, l'abilitazione ai ministeri ecclesiali, il desiderio di approfondimento biblico o l'esigenza di una maturazione personale.

In occasione del venticinquesimo dell'ISSR è stato pubblicato il volume:

Teologia: itinerario verso una fede adulta. Per il venticinquesimo della Scuola di Teologia "S. Pietro Martire" di Verona (1967-1992), Il Segno, Verona 1993, 292 pp.

contenente i seguenti contributi:

Studi
G. Gottardi, Venticinque anni di vita della Scuola di Teologia "S. Pietro Martire", 13-56.
P. Vanzan, Teologia e popolo di Dio nella Chiesa locale, oggi, 57-90.
S. De Guidi, Il valore della teologia nella formazione del cristiano, 91-176.
D. Cervato, Teologia e laici nella chiesa veronese (dal'Umanesimo ad oggi), 177-232.

Testimonianze
I. Bonetti, Il ricordo degli inizi.
F. Dalla Riva, La teologia e la vita cristiana.
G. Benetti – R. Benetti, La teologia e la vita nel matrimonio.
E. Cupani, La teologia e la vita nella comunità religiosa.